载人航天工程测控通信系统总体方案设计是一项庞大的系统工程。按要求，这套方案必须把由神舟飞船、三个中心、四条测量船和十几个测控站的成千上万台设备组成的测控网连接起来，哪怕是有一个接口不通，都会直接影响到整个测控网。

　　为满足“高实时、高覆盖、高速率、高可靠”的要求，他们大胆创新、集智攻关，在较短时间内实现了测控通信系统的透明工作方式、远程监控和统一指挥调度、天地话音、电视图像和高速数据传输、天地电磁兼容和国际联网等一系列重大技术突破，设计并建成了包括三个测控中心、遍及海内外的10几个测控站（船）。尤其是经过“神舟”1号试验以来，系统技术指标先进，操作管理便捷得到了充分检验，整体性能达到了国际先进水平，表明我国航天测控通信系统的设备与技术完全满足载人航天工程以及未来航天飞行器测控的要求。

　　针对神舟六号有多人多天以及空间实验活动增多的特点，于总说，神舟六号不是神舟五号的简单重复。近两年的时间里，他们在系统上做了一些适应性的提高和完善，以增加系统的安全性和可靠性。比如，为了更好地获取火箭上升段的一些运行过程和一些重大动作的情况，他们利用大树里站的大型光电望远镜和雅布赖站新上的光学实况记录系统可获取火箭起飞后20秒至整流罩分离后80秒的火箭飞行实况景象，在火箭飞行过程中，可实时观测和记录运载火箭的逃逸塔分离、助推器分离、一二级分离、飞船整流罩分离等关键飞行事件。

　　于总和同事们的压力都非常大，因为自飞船发射起到落地，乃至监测留轨舱，测控通信系统是全程跟踪，全程支持。多天飞行，不但工作量和难度增大，不可预料事件发生的机率也增多了，这是对系统的考验，也是对参试人员处理应急事件能力的考验。由于测控通信系统规模庞大，分布比较广，全球有13个测量船（站）和3个中心，要把这种多领域、多手段、多学科的一个系统结合在一起，使系统有效、步调一致难度是很大的。同时，多人多天的试验要比一人一天试验过程中出现故障的可能性要大，每一个部件，每一台设备工作都得正常，要求相对来说较难。于总说，可预料事件的都有了相应的应急措施，但没预计的事件一旦发生，就要求我们适时、及时地决策分析，这是对我们这支队伍的考验。