赵勇:计算机辅助药物筛选平台助力新药研发

11月5—6日,由北京市科学技术委员会主办,北京生物技术和新医药产业促进中心承办的第二十二届北京国际生物医药产业发展论坛在北京顺利召开。在创新药研发服务关键技术平台突破与发展分论坛上,北京北科德源生物医药科技有限公司总经理赵勇做了《计算机辅助药物筛选平台》的主旨演讲。

目前,中国新药研发存在着三个问题,一是周期长,二是费用高,三是失败率比较高。而国外在近年,每年都有一些新药,2017年就有47个新药研发通过。

怎么解决?可以举一个非常经典的案例。治疗肺小细胞肺癌的药,上市只花了两年半的时间。后来记者采访主要项目负责人,得到的答案是并没想象的那么难,他们利用的就是计算机辅助药物设计,或者叫CADD。核心内容就是计算机辅助药物筛选,筛选和设计没有什么太大的区别。

计算机辅助药物设计在一些新药研发里,主要在生物信息分析的基础上去做,位点非常靠前,也就是早期研发。如果有蛋白质结构,就基于蛋白质结构去做药物设计或者筛选,如果没有,一些相关的实验内容也可以做分析。

北科德源生物医药科技有限公司就是致力于人工智能技术链接生物医药,现在正在做的包括生物药物分析、药物靶点分析、计算机药物辅助设计、还有ADMET。

不同之处在于,我们做完计算机辅助药物筛选或设计后,可以通过分子对接的方法检验它的效能,看它有没有到口袋里面去,它是和哪几个氨基酸相互作用,和哪几个氨基酸以什么样的方式相互作用。

着眼细节。我们知道每个人的基因都不一样的,患病的时候用的药物事实上是跟氨基酸靶点的相互作用。简言之,就是取决于那几个氨基酸,如果氨基酸突变了,效能可能就不同了。在临床上有大概25到75%的可能性,病人吃了药是没效的,这跟他的基因高度相关,这也是我们做这方面努力的原因。

做药物筛选的时候,要用到的小分子化合物是数以千万计的,目前已知的药物靶标也是数以百万计的,这个时候要做的工作,就是分子对接的过程。平常的计算机做,一次对接如果需要两秒钟,一个靶点的筛选是470天的。而目前我们建的这个平台,是以北京市计算机的次算平台为基础建立起来的,目前北京市计算机超算中心达到500亿次每秒钟。

公司目前的计算机辅助药物筛选平台事实上应该叫功能性化合物发现平台,不仅可以做所谓的药,还可以做农药,还可以做杀虫剂一类的东西,应用面很广。

随着公司近年的发展,像生物信息分析、个性化癌症疫苗的设计以及后面涉及的内容已经做得比较成熟。。

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责任编辑:马嘉悦
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