天大生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线向全球开放服务

2020-01-31 10:38:09 来源: 科技日报 作者: 陈曦 赵晖

    科技日报 陈曦 通讯员 赵晖

31日从天津大学获悉,该校生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线,并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。

新型冠状病毒基因组注释数据库 ZCURVE_CoV Database 网站截图

面对疫情加快蔓延的严重形势,科技界正在争分夺秒与病毒抗争,开展病毒防治相关药物的研发。鉴于目前在美国NCBI网站上公布的新型冠状病毒全基因组序列,很大一部分缺少详细的基因组注释,尤其是对多聚蛋白酶切位点的注释,天津大学生物信息中心的高峰教授、罗昊博士采用已研发的ZCURVE_CoV系列软件,对包括新型冠状病毒(2019-nCoV)在内的两千余株冠状病毒的基因组进行了基因识别和酶切位点预测,并以数据库(ZCURVE_CoV Database)的形式提供网上服务(http://tubic.tju.edu.cn/CoVdb或http://tubic.org/CoVdb/)。

该数据库有望为新型冠状病毒基因组结构、基因功能及病毒起源与变异以及药物研发等重大问题的研究提供科学根据。作为合作单位之一,该数据库也可在国家基因组科学数据中心网站(https://bigd.big.ac.cn/)通过跨库检索形式访问。

责任编辑: 陈小柒