科技日报记者 张佳欣
人体由约30万亿个细胞构成,每个细胞每秒发生近10亿次化学反应。一分钟内的生命活动规模如此庞大,以至于“百亿亿次”这样的数值也仅能描述其冰山一角。
近年来,科学家不断深入探索细胞内部,从细胞核到基因组,逐步揭示微观世界的复杂性。他们发现,大多数人类疾病并非单一因素导致,而是源于错综复杂的生物网络共同作用。面对浩瀚的生命数据,传统方法难以应对。如今,人工智能(AI)正成为破解这一难题的关键。
读懂“生命语法”
AI正以一种突破性的视角重新解读生物学:它将蛋白质序列视为一种可被解译的语言。
正如自然语言由字母和标点组成,构成细胞、骨骼和肌肉的蛋白质,是由一串串氨基酸组成。生物学家发现,大型语言模型同样可用来识别氨基酸链中的潜在规律。
美国Dyno医药公司首席执行官埃里克·凯尔西克坦言:“我曾认为蛋白质复杂到无法理解。但数据中自藏秩序,譬如哪些氨基酸可置于衣壳的特定位置。现在,我们可利用AI自动分析数据,发现人类难以发现的规律。”该公司正利用AI设计病毒衣壳,以实现更安全、高效的基因疗法。
AI的高效分析能力意味着,像Dyno这样的公司可开发用于罕见病的基因疗法载体。若AI能为每个人定制基因疗法,医疗将真正走向个性化、规模化。长远来看,从心脏病到肥胖,任何与基因相关的疾病都有望被重新定义。届时,人们将不再视基因组为既定命运,而是可编辑的“生命脚本”。
寻找生命“暂停键”
若AI能解读生命,它是否也能帮人类存留生命?
60多年来,科学家一直在尝试安全冷冻人体,以待未来科技将其唤醒。如果能安全地冷冻和解冻生物组织,医疗领域将迎来巨变。例如,器官可冷冻储存用于移植,绝症患者可冷冻待治愈后复活。
由前谷歌大脑科学家马克·伍德沃德创立的生物科技初创公司Wake Bio正利用机器学习开发可实现全身冷冻保存的技术。其重点在于开发“抗冻保护剂”,即一款在冷冻和解冻过程中保护细胞完整性的化学混合物。
抗冻保护剂的成分组合近乎无限,AI可从亿万候选分子中筛选最优解,并在虚拟环境中完成测试。“我们将实验结果反馈给模型,它提出新假设、预测结果,循环迭代,不断逼近可行方案。”伍德沃德解释道。
这种“数字实验”模式正席卷生命科学领域,人类提出方向,AI执行推演。科学家的角色,正从操作者转向AI的引导者。
加速科学发现
Wake和Dyno的AI模型用于非常具体的任务,而非营利研究机构“未来之屋”的目标更宏大。
“人类基因组有两万个基因,你既无力全部研究,也难以记住所有发现。”“未来之屋”首席执行官塞缪尔·罗德里格斯说,“我们需要的是能自主思考、假设和验证的AI。”
“未来之屋”致力于通过AI代理加速科学研究,其AI模型能够分析生物数据,生成新的科学假设,并通过数字化实验验证假设。这些过程所需的时间和成本仅仅是人类科学家的零头。
今年5月20日,该机构演示了一套多智能体科学发现工作流程,旨在实现自动化科学流程的关键步骤,并确定了一种新的治疗干性年龄相关性黄斑变性的候选药物。6月,该机构发布了ether0,这是一个240亿字节的开放权重AI化学推理模型。
他们开发的一系列AI科学代理,已能处理实验数据、查阅文献、设计实验流程、预测分子互动。尤其在新药研发这样高成本、长周期、跨学科的领域中,此类系统有望将原本数年的决策压缩至秒级,大幅降低新药成本,可更快惠及患者。
逆转衰老时钟
深耕这一领域的美国Retro生物科技公司,试图用AI破解衰老密码。
该公司首席执行官乔·茨—拉克鲁瓦受到蛋白质语言模型的启发,认为类似技术可推广至更多生物数据研究中。其团队专注于细胞衰老方面,这一过程伴随蛋白质功能失调,最终引发癌症、阿尔茨海默病等与年龄相关的疾病。逆转衰老,需洞察细胞如何调度数以百万计的蛋白质,而这远非人力所能及。
与OpenAI合作,Retro开发出能理解蛋白质机制的生成模型,并借此改良“山中因子”(一组可令细胞重编程、回归年轻状态的基因),使其重编程效率最高提升50倍。一旦广泛应用,细胞重编程技术或可让人体在生物学上实现年轻化,延缓甚至逆转衰老进程。
然而,AI亦带来“黑箱”难题,毕竟无人能逐步解释其决策机制,这令许多人感到不安。
目前,人们仍然可选择观望,但随着AI不断融入医学,它正逐渐成为不可回避的力量。或许在不久的将来,当面对AI提供的治疗方案时,人们不只是“不得不尝试”,而是会把它视为延长生命、改善健康的新契机。