科技日报记者 孙明源
近日，北京分子之心科技有限公司（简称“分子之心”）自主研发的反应性原子建模平台QuantaMind相关研究发表于国际学术期刊《科学进展》（Science Advances），该成果将接近密度泛函理论（DFT）精度的反应性分子动力学首次推进至数万原子级生物体系和数十纳秒时间尺度；论文提交后的最新扩展测试进一步达到了十万原子级规模和百纳秒时长尺度。
论文通讯作者、分子之心创始人许锦波解读说，这一突破意味着AI大分子设计实现了“动态反应模拟”，即化学反应可以在计算端提前推演和理解。
许锦波介绍，将反应性分子动力学真正应用于大型生物分子体系，长期面临着精度、速度与尺度难以兼得的困境。QuantaMind通过创新数据工程与模型架构，第一次把这三个维度同时推到生物研发可用的范围。
计算效率的突破，是让反应性分子动力学从理论可行走向实际可用的关键。论文内容显示，借助NVIDIA A100 80GB GPU，QuantaMind的推理速度可达到4.2×10⁻⁶秒/原子/步，与当前最先进的机器学习力场相当。最新测试显示，QuantaMind的推理速度达到2.1×10⁻⁶秒/原子/步，可将十万原子级反应体系单位时间步的模拟计算耗时降至0.25秒。
“在应用效率突破的同时，QuantaMind在规模和时长两方面也实现了同步跨越。在规模上，最新扩展测试已达十万原子级；在时长上，最新扩展测试已推进至百纳秒尺度。”许锦波介绍。
QuantaMind的发布，标志着分子之心补齐了AI分子研发闭环中的关键一环。分子之心已构建起“生成—设计—预测—机理理解”的技术矩阵，这些功能都将集成至分子之心AI原生生物经济操作系统MoleculeOS。
许锦波表示，QuantaMind有望成为连接分子设计、机制模拟与实验验证的关键基础设施。当AI能够理解分子动力学的内涵时，蛋白质设计将逐步形成“预测结构—设计结构—模拟反应”的完整技术链路。
网友评论
