青岛能源所解析米卡芬净前体合成机制

2023-03-10 20:11:14 来源: 科技日报 作者: 宋迎迎 黄雪年 门萍

科技日报记者 宋迎迎 通讯员 黄雪年 门萍

3月10日,科技日报记者从中国科学院青岛生物能源与过程研究所(以下简称“青岛能源所”)获悉,该所研究团队解析了环脂肽类天然产物FR901379的完整生物合成途径和调控机制,尤其是详细阐明了磺酰化形成机制,在此基础上通过代谢工程改造,显著提高了工业菌株的发酵性能,并基于磺酰化模块创制了水溶性提高数千倍的新型磺酰化棘白菌素类化合物。相关成果发表于《代谢工程》和《微生物细胞工厂》。

棘白菌素类抗真菌药物是治疗深部真菌感染的一线临床用药,其中米卡芬净因存在天然磺酰化修饰具有很好的水溶性。棘腔孢霉发酵生产的环脂肽类天然产物FR901379是米卡芬净工业生产的前体化合物,其发酵效率低使得米卡芬净生产成本居高不下,限制了米卡芬净的市场应用。解析FR901379生物合成机制,开展工业菌株理性改造是提高米卡芬净生产效率的重要研究方向。

FR901379合成调控机制解析及其应用。黄雪年 门萍制图

研究团队首先对FR901379合成基因簇进行了生物信息学预测,通过基因敲除进行了系统验证并提出FR901379环脂肽骨架的生物合成途径;利用HMMER构建隐马尔可夫模型预测同源基因,并结合差异转录组数据筛选可能负责氧磺酰基基团合成的候选基因。体内敲除和体外酶活结果表明,氧磺酰化修饰是由细胞色素P450酶McfP和磺酰基转移酶McfS在环脂肽后修饰阶段完成的。

阐明FR901379生物合成机制后,研究团队针对棘腔孢霉发酵过程中存在产量低、副产物难分离等问题,开展了系统的工业菌株理性改造研究,使FR901379合成途径全面上调,摇瓶产量也提高了3倍。为了减少因氧化不充分导致的中间产物积累,团队对关键的后修饰限速酶McfF和McfH进行过表达,合成途径优化后副产物含量减少80%以上,产量也进一步显著提高,最终在5L发酵罐中产量达到4.0g/L,高于现有工业水平。

磺酰基基团能够增加化合物的水溶性,进而增加药物的生物利用度,为了创制更多的磺酰化棘白菌素类化合物,研究团队将磺酰化模块在抗真菌药物卡泊芬净前体(纽莫康定B0)生产菌株中进行了异源重构,成功获得了氧磺酰化纽莫康定B0,其水溶性提高了4000多倍,该研究为创制更多磺酰化棘白菌素类化合物提供了酶学元件和可行性验证。

该研究完整解析了FR901379的生物合成机制,在此基础上对FR901379合成途径的适配性进行了优化,并创制了水溶性的新型磺酰化棘白菌素类化合物,为米卡芬净生产工艺提质增效奠定了基础,同时也为药物水溶性提高提供了新思路。

责任编辑: 陈可轩