科技日报记者 魏依晨 通讯员 刘丽婷
近日,江西省林业科学院联合省林业科技实验中心研究采用PacBio HiFi长读长测序结合Hi-C技术在国内率先获得首个染色体级别花榈木全基因组。相关研究论文发表于《自然》子刊《科学数据》。
据介绍,花榈木染色体水平基因组总大小为2.69Gb,BUSCO评估验证基因组完整性达98.20%,其中共功能注释到37366个基因,鉴定到2518个rRNA和1120个tRNA等非编码RNA。
该基因组的发布填补了花榈木遗传学研究的空白,作为红豆属物种里少有的大基因组,其高重复序列比例与LTR主导的特征,为解析豆科基因组扩张机制提供了新视角,同时为花榈木药用成分生物合成途径的解析及红豆属相关濒危物种的保护与资源综合开发利用提供了重要分子依据与理论基础。
(江西省林科院珍贵树种团队供图)