科技日报记者 刘霞
美国科学家在近日出版的《新英格兰医学杂志》上发表研究报告称,他们通过最新实验证明,快速基因组测序与解读可在数小时内完成。这一突破不仅创造了迄今人类全基因组测序最快纪录,更标志着临床医学的一大进步,有望为重症婴儿提供更精准、更及时的治疗。
目前,临床常用的快速基因组测序,从样本接收到出具报告通常需要数天时间。然而,新生儿重症监护病房中的许多救治决策,必须在几小时内作出。尽管此前已有研究在数小时内可完成基因组测序,但尚未形成可推广、适用于常规临床使用的方案。
在最新研究中,波士顿儿童医院、博德临床实验室与罗氏测序解决方案公司合作,模拟出一套高效工作流程:清晨从婴儿体内采集样本进行基因组测序,当天下午即可完成诊断并出具报告。
研究团队使用罗氏测序解决方案的扩展测序原型,对15个人类样本进行了测序与分析,其中包括来自波士顿儿童医院的5个历史病例,以及来自该院新生儿重症监护室的7个病例。他们在样本处理方面取得了惊人速度,从提取DNA到获取遗传变异数据,最快一次用时仅3个多小时。对许多家庭而言,这将彻底改变罕见病的诊断现状。
研究团队表示,这一成果距离实现“床旁基因组测序”更近了一步,有望纳入重症监护机构的常规诊疗标准。